Vários factores podem contribuir para a contaminação em salas limpas. As más práticas de vestuário, como a colocação ou remoção incorrecta de EPI, podem introduzir partículas em ambientes controlados. Os contaminantes transportados pelo ar, incluindo poeiras, micróbios e células da pele, representam um risco significativo para a integridade do produto. Os problemas de integridade do EPI, como rasgões, furos ou ajuste incorreto, também podem levar à contaminação. Além disso, o manuseamento incorreto dos materiais e as superfícies não protegidas podem introduzir partículas que comprometem as normas das salas limpas.