Một vài nhân tố có thể gây ra rủi ro nhiễm bẩn trong phòng sạch. Thực hành mặc đồ bảo hộ kém, ví dụ: mặc hoặc cởi PPE không đúng cách, có thể khiến các hạt bụi xâm nhập môi trường kiểm soát. Các chất gây ô nhiễm trong không khí, bao gồm bụi, vi khuẩn và tế bào da, gây ra rủi ro đáng kể đối với tính toàn vẹn của sản phẩm. Các vấn đề về tính toàn vẹn của PPE, như rách, thủng hoặc không vừa vặn, cũng có thể dẫn đến nguy cơ nhiễm bẩn. Ngoài ra, việc xử lý vật liệu không đúng cách và các bề mặt không được bảo vệ có thể gây ra sự xâm nhập của các hạt bụi, làm ảnh hưởng đến các tiêu chuẩn phòng sạch.